全面覆盖GROMACS分子模拟的技术支持服务

本指南为科研人员提供2026年度最新的GROMACS分子动力学模拟技术指导，涵盖从软件安装到复杂体系建模、轨迹分析及程序开发的全套。
我们提供有偿技术支持，服务范围广泛，适用于生物学、材料科学、环境工程等多个研究方向。

支持多种生物大分子体系的建模与模拟

可针对蛋白质、蛋白-配体复合物、DNA结构、磷脂双分子层等各类生物系统进行精准建模和动力学模拟，确保力场选择合理、初始构象优化到位，助力深入理解分子行为。

GROMACS跨平台安装保障服务

无论您使用的是Windows还是Linux操作系统，均可获得任意版本GROMACS软件的完整安装支持，确保环境配置无误，一键运行无故障。

多类型轨迹文件的深度分析能力

不仅支持GROMACS原生轨迹，还可处理LAMMPS等其他模拟软件输出的轨迹数据，进行结构演化、相互作用动态及统计特性分析。

特殊物理条件下的模拟技术支持

包括超声环境下基于正弦压力调控的模拟，并提供修改后的GROMACS源码，满足极端或非平衡态条件的研究需求。

电解液与离子溶剂化结构的专业解析

提供SSIP、CIP、AGG等离子缔合结构比例分析，以及离子液体中溶剂化层组成和物种分布的详细统计结果。

复杂体系建模与高级分析功能

涵盖超临界CO₂模拟参数设置、多糖类物质（如直链/支链淀粉）建模、水合物剪切应力计算、电荷密度二维热图绘制、界面扩散系数（含Dz）分析、聚合物内聚能密度（CED）评估等多项高阶功能。

定制化工具与程序开发支持

基于sobtop开发的genMol2工具可高效生成聚合物拓扑并应用RESP电荷；支持Trappe力场小分子在GROMACS中的拓扑构建；提供水合物笼识别程序，兼容多种轨迹格式并输出PDB便于可视化。

纳米材料与功能化表面建模

包括功能化石墨烯、碳纳米管模型构建，金属表面（Au、Fe、Cu、TiO₂等）吸附模拟，有机修饰界面建模，以及水/油/气/固多相界面系统搭建。

专业分析模块与可视化服务

涵盖氢键网络分析（占有率、键长键角、接触图）、MMPBSA结合能与IE熵计算、DSSP二级结构、拉氏图、自由能面FEL三维绘图、二面角势函数拟合、序参数F3/F4计算等功能，并支持VMD脚本定制开发。

多样化力场与外部场模拟支持

提供Clayff黏土力场、Buckingham参数（ZrO₂/Fe₃O₄）、OPLS-AA/Amber力场参数化、外加电场（方波及其他波形）模拟设置等专项指导。

个性化编程与代算服务

支持C/C++/Python/Shell/AWK/TCL(VMD)等语言编程辅导，Autodock Vina 1.2 Windows 64位安装服务，以及各类模拟代跑、批量计算任务托管。

服务说明与注意事项

所有服务均根据具体需求难度和耗时定价，需私聊沟通细节后确认费用。
不接受无偿索取，谢绝白嫖用户咨询。